差補(bǔ)事業(yè)單位即差額撥款事業(yè)單位，是指單位自身有一定的收入（穩(wěn)定的經(jīng)常性的收入），但是這里的收入不能夠滿足單位自身的支出，此時就需要申請財政撥款，這種支出大于收入，國家予以撥款的單位就是差額撥款事業(yè)單位。

全額撥款事業(yè)單位和差額撥款事業(yè)單位的區(qū)別：

一是公益屬性不同。全額撥款事業(yè)單位公益性質(zhì)更為明顯，本身不參與經(jīng)營活動，不產(chǎn)生經(jīng)濟(jì)收益；差額撥款的事業(yè)單位具有一定公益服務(wù)項目，但自身通過服務(wù)和經(jīng)營要產(chǎn)生一定的經(jīng)濟(jì)收益。

二是單位發(fā)揮的職能不同。全額撥款的事業(yè)單位屬于公益一類的事業(yè)單位，比如中小學(xué)校、基礎(chǔ)科學(xué)研究、社會科學(xué)研究、文化體育、公共衛(wèi)生等；差額補(bǔ)款的事業(yè)單位屬于公益二類的事業(yè)單位，比如高等學(xué)校、實(shí)用性的科研院所、文化演出單位等。

三是經(jīng)費(fèi)來源不同。全額撥款事業(yè)單位其經(jīng)費(fèi)來源全部由財政全額撥款，包括人員的工資、社會保險、辦公經(jīng)費(fèi)等全部來源財政開支；差額撥款的事業(yè)單位，財政是按照差額部分進(jìn)行撥款，自身會產(chǎn)生一定的收入來源，比如醫(yī)院，文化體育部門的部分事業(yè)單位等。

四是職業(yè)年金記賬方式不同。全額撥款的事業(yè)單位工作人員的職業(yè)年金，除了個人繳費(fèi)部分實(shí)行實(shí)賬管理以外，單位繳費(fèi)部分實(shí)行虛賬管理，待工作人員退休時再由財政撥付記實(shí)；差額撥款的事業(yè)單位，無論是單位繳費(fèi)部分還是個人繳費(fèi)部分，都是按照實(shí)賬進(jìn)行管理。

五是工作人員的收入不同。全額撥款的事業(yè)單位工作人員工資福利待遇，要按照事業(yè)單位的工作人員工資管理辦法執(zhí)行，工資要全部納入財政預(yù)算，只能在財政預(yù)算的范圍內(nèi)支付；差額事業(yè)單位由于有一定的經(jīng)營收入，除了基本工資以外，大部分收入來源于績效工資，平均收入水平會高于全額撥款的事業(yè)單位。

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