主要有以下幾方面：

一是工作性質(zhì)方面，公務(wù)員從事的主要是國家行政事務(wù)性工作；事業(yè)單位從事的主要是社會公益性工作，或者說是非營利性工作。

二是工資收入方面，公務(wù)員的收入是按照國家公務(wù)員管理條例的規(guī)定發(fā)放，并根據(jù)國家財政的狀況進行調(diào)資；事業(yè)單位的工資收入一般不受國家約定，由各事業(yè)單位根據(jù)市場情況而定。一般來說事業(yè)單位的工資收入比公務(wù)員高。

三是保險福利方面，公務(wù)員享受的保險福利是按照國家公務(wù)員管理條例的規(guī)定執(zhí)行；事業(yè)單位人員享受的保險福利是按照國家有關(guān)的社會保障規(guī)定執(zhí)行，一般要逐步實行社會化。一般來說，公務(wù)員享受的福利待遇比事業(yè)單位人員的要好些。

四是用人方面，公務(wù)員的錄用、提升、退休、辭退、辭職等是按照國家公務(wù)員管理條例的規(guī)定執(zhí)行；而事業(yè)單位的錄用、提升、退休、辭退等，是按照國家勞動法的有關(guān)規(guī)定執(zhí)行，但事業(yè)單位對人員的管理權(quán)限要大一些

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